EpiTect Bisulfite Kits完全的重亚硫酸盐转化并回收DNA,用于甲基化分析快速可靠在6小时获得实验结果2 μg 模板可获得99%以上的转化率独特的DNA保护体系用于高度敏感的分析经优化的操作方法可处理福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本DNA提供离心柱或者96孔板方式EpiTect Bisulfite Kit可在6小时内将DNA 序列中未甲基化的胞嘧啶完全转化为尿嘧啶。高灵敏度的方法采用全新的保护机制防止DNA降解,确保即使是1 ng的DNA也可获得灵敏的结果,转化率可高达99%。得益于独特的DNA保护技术,EpiTect Bisulfite转化后DNA高度适用于EpiTect Whole Bisulfitome Kits的转化后全基因组扩增。因此可在转化后DNA量较少的情况下确保可靠的扩增。EpiTect Bisulfite Kits包括离心柱或96孔板形式的纯化和脱磺酸基过程,确保快速可靠的实验结果用于下游应用。两个试剂盒都可应用离心机或真空装置,另外,EpiTect Bisulfite Kit 可在QIAcube上全自动运行。操作简单EpiTect Bisulfite 操作流程基于QIAGEN简单直接的结合、洗涤和洗脱体系,仅需几个简单的步骤(见流程图 EpiTect 亚硫酸氢盐转化步骤)。DNA经过热变性和亚硫酸氢盐转化后,被上样到EpiTect分离柱或96孔板上,使用优化的缓冲液和标准化的离心步骤或真空装置,洗去所有的亚硫酸氢钠并洗脱DNA。洗脱的DNA可用于各种下游应用,如:甲基特异性PCR,定量PCR分析,硫酸氢盐测序(bisulfite sequencing),结合亚硫酸氢盐的限制性内切酶法分析(COBRA)和焦磷酸测序(Pyrosequencing)。 快速得到实验结果 完整的EpiTect离心和真空过程--从DNA到待分析的亚硫酸氢盐转化后的高纯DNA--只需6小时。试剂盒提供所有必需的缓冲液和试剂,仅需很少的操作步骤。传统的亚硫酸氢盐转化过程需要18个小时,且需要大量的操作(见图“快速简单的亚硫酸氢盐转化”和 “节约时间的操作步骤”)。EpiTect Bisulfite试剂盒为成功进行亚硫酸氢盐转化和DNA回收提供所需的全部试剂。 快速简单的亚硫酸氢盐转化 EpiTect 传统操作 反应构建 10 分钟, 预制溶液 40 分钟,需反应构建 亚硫酸氢盐转化 5 小时 16 小时 纯化 30-45分钟; EpiTect 离心柱或96孔板 120 分钟;纯化、脱磺、沉淀和洗涤 完全的DNA转化每个EpiTect Bisulfite Kit可以相同的效率转化,低至1 ng 到2 µg DNA起始样本。全新的实验步骤和优化的缓冲液可回收得到高产量的转化后DNA。当通过定量PCR扩增经转化的DNA时,低CT值的实验结果显示了高效的胞嘧啶转化(见图 “完全的胞嘧啶转化”)。对转化的DNA的分析显示,EpiTect Bisulfite Kit可转化超过99%的未甲基化的胞嘧啶(见图:“高效胞嘧啶转化”)。高转化率确保了高重复性和可靠的下游分析结果。 独特的DNA保护DNA保护缓冲液采用独特的配方,防止DNA过度片段化(在高温、低pH值条件下使用亚硫酸氢盐处理DNA时经常出现严重的DNA片段化),并实现有效的DNA变性,从而产生完全转化胞嘧啶时所需的单链DNA(见图“独特的DNA保护缓冲夜合pH指示剂”)。防止DNA片段化的发生可以保证后续大PCR片段的扩增和分析(见图 “最少量模板DNA的大规模 PCR扩增”)。这一有效的完整DNA回收可保证转化后的DNA可至少保存12个月而不影响DNA的品质(见图 “DNA长期储存”)†。此外,DNA保护缓冲液包含有PH指示剂染料,从而可保证用于胞嘧啶转化的正确的pH条件。 † 更长时间的转化后DNA的保存方法正在研究中。请联系QIAGEN获取详细信息。 特殊样本的亚硫酸氢盐转化从珍稀样本和少量样本(如:福尔马林固定、FFPE石蜡包埋或显微切割组织)中确定甲基化模式,由于DNA的量很少,实验尤其困难。但是这些样本类型是成功鉴定有价值的疾病预测生物标记的专门研究对象。 EpiTect Bisulfite Kits 为这些类型的样本提供优化的操作流程,从而解决了难题 (见“FFPE组织样本的甲基化检测”)。 表观遗传学标准化流程表观遗传学信息对于生物医学研究(尤其是肿瘤学),干细胞研究以及发育生物学等领域都非常重要。但是分析DNA甲基化的变化目前仍具有挑战性,因为缺乏标准化的方法可从有限的样本中得到高重现性的数据。QIAGEN